17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4690 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4690  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7002  hypothetical protein  28.24 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  30.14 
 
 		 335 aa  62  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  30.32 
 
 		 333 aa  57  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  34.07 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 326 aa  52.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 332 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  26.36 
 
 		 333 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1996  hypothetical protein  27.61 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3156  hypothetical protein  36.47 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0762  hypothetical protein  39.66 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359066  normal  0.554709 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2426  hypothetical protein  24.43 
 
 		 336 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  23.93 
 
 		 339 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3615  hypothetical protein  32 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1940  hypothetical protein  29.07 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1224  hypothetical protein  37.29 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>