21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4861 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 333 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  48.62 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  47.62 
 
 		 335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  42.69 
 
 		 328 aa  248  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  30.38 
 
 		 334 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  28.38 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2426  hypothetical protein  28.3 
 
 		 336 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  25.42 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  30.08 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  32.04 
 
 		 168 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4690  hypothetical protein  26.36 
 
 		 183 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0419  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 189 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000615648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  29.7 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1316  hypothetical protein  32.97 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000132332  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1441  hypothetical protein  28.8 
 
 		 137 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3859  hypothetical protein  34.74 
 
 		 132 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.632136  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0889  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 132 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  20.57 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0762  hypothetical protein  25.96 
 
 		 183 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359066  normal  0.554709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>