36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2502 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 333 aa  676    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  34.66 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2426  hypothetical protein  31.91 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  32.45 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  30.25 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  30.87 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  28.25 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  34.27 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  30.86 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  26.37 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  28.38 
 
 		 333 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  27.62 
 
 		 335 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  35.37 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1316  hypothetical protein  31.9 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000132332  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4657  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4690  hypothetical protein  30.32 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0762  hypothetical protein  31.47 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359066  normal  0.554709 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  23.16 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0889  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 		 132 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3859  hypothetical protein  31.78 
 
 		 132 aa  50.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.632136  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0419  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 		 189 aa  49.7  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000615648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  29.25 
 
 		 168 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 131 aa  49.7  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2210  XRE family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 157 aa  49.3  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.752058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3487  hypothetical protein  29.11 
 
 		 274 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000017923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1441  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0363  XRE family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 133 aa  47  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3528  XRE family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 133 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1536  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 133 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1337  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 136 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4204  Cro/CI family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 133 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1649  helix-turn-helix domain-containing protein  29.91 
 
 		 133 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1375  XRE family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 136 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4193  XRE family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 133 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4634  helix-turn-helix domain-containing protein  28.95 
 
 		 133 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>