43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1410 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  344  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2307  hypothetical protein  38.17 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  36.57 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209704  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3859  hypothetical protein  34.88 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.632136  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0889  putative transcriptional regulator  34.88 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1441  hypothetical protein  35.9 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1316  hypothetical protein  35.77 
 
 		 214 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000132332  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2210  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.752058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0679  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02843  hypothetical protein  30.23 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0676  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3199  Cro/CI family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4634  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02893  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.23 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0363  XRE family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4148  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0797664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3528  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5547  XRE family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.273905 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4193  XRE family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3776  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  32.04 
 
 		 333 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4204  Cro/CI family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 133 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1649  helix-turn-helix domain-containing protein  31.07 
 
 		 133 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4657  XRE family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  30.6 
 
 		 332 aa  50.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1536  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  31.58 
 
 		 332 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0845  XRE family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  26.15 
 
 		 131 aa  48.5  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  30.61 
 
 		 333 aa  48.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  29.31 
 
 		 334 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  27.35 
 
 		 335 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1375  XRE family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  28.42 
 
 		 328 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  26.96 
 
 		 334 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1337  transcriptional regulator, XRE family  28.68 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  28.23 
 
 		 339 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2211  hypothetical protein  29.01 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.371896  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0530  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 339 aa  42  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1988  transcriptional regulator, XRE family  30.93 
 
 		 132 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  25.25 
 
 		 326 aa  41.2  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1570  hypothetical protein  36.54 
 
 		 84 aa  41.2  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104651  normal  0.046971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>