37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4193 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4193  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 133 aa  273  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1536  XRE family transcriptional regulator  84.96 
 
 		 133 aa  220  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3528  XRE family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 133 aa  200  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0363  XRE family transcriptional regulator  67.67 
 
 		 133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5547  XRE family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 133 aa  191  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.273905 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4634  helix-turn-helix domain-containing protein  70.99 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3776  XRE family transcriptional regulator  70.68 
 
 		 133 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4204  Cro/CI family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1649  helix-turn-helix domain-containing protein  66.17 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0889  putative transcriptional regulator  50.38 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3859  hypothetical protein  50.38 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.632136  normal  0.0282263 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0679  transcriptional regulator, XRE family  50.38 
 
 		 131 aa  147  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3199  Cro/CI family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 131 aa  147  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02843  hypothetical protein  50.38 
 
 		 131 aa  147  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02893  predicted DNA-binding transcriptional regulator  50.38 
 
 		 131 aa  147  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0676  XRE family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 131 aa  147  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2210  XRE family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.752058  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2211  hypothetical protein  45.11 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.371896  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  45.8 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0845  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1375  XRE family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 136 aa  97.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1988  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1337  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 136 aa  95.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4148  XRE family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0797664 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4657  XRE family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1441  hypothetical protein  33.82 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  32.54 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1834  transcriptional regulator, XRE family  65.22 
 
 		 52 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2307  hypothetical protein  31.97 
 
 		 204 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  28.1 
 
 		 333 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  34.88 
 
 		 334 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5658  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2216  hypothetical protein  25.2 
 
 		 295 aa  43.9  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0015344  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 333 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3602  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4076  helix-turn-helix domain-containing protein  29.36 
 
 		 157 aa  40  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>