68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0845 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0845  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  275  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  76.34 
 
 		 131 aa  219  8e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1337  transcriptional regulator, XRE family  82.31 
 
 		 136 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1375  XRE family transcriptional regulator  82.31 
 
 		 136 aa  216  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0363  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 133 aa  106  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3528  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4148  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0797664 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4634  helix-turn-helix domain-containing protein  46.21 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5547  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.273905 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0679  transcriptional regulator, XRE family  34.35 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02843  hypothetical protein  34.35 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0676  XRE family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4193  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3199  Cro/CI family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02893  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.35 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  36.72 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209704  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1536  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3859  hypothetical protein  35.88 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.632136  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0889  putative transcriptional regulator  35.88 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2210  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.752058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1988  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4204  Cro/CI family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3776  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1649  helix-turn-helix domain-containing protein  38.64 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1834  transcriptional regulator, XRE family  84.09 
 
 		 52 aa  80.1  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4657  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2211  hypothetical protein  28.37 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.371896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1441  hypothetical protein  34.11 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2974  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2307  hypothetical protein  26.45 
 
 		 204 aa  50.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  25.6 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3172  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100844 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0975  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1845  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1042  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0468  helix-turn-helix domain-containing protein  33.9 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  33.9 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000318206  hitchhiker  0.000000295064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1619  hypothetical protein  39.22 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2546  transcriptional regulator, XRE family  43.59 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3850  virulence gene repressor RsaL  34.55 
 
 		 95 aa  42.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1065  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4312  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0881286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2738  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2370  transcriptional regulator-like  32.73 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2894  transcriptional regulator-like protein  32.73 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  30.61 
 
 		 334 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3004  transcriptional regulator-like protein  32.73 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1818  XRE family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 107 aa  42  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3031  transcriptional regulator-like protein  32.73 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2984  transcriptional regulator-like protein  32.73 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1708  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6333  transcriptional regulator-like  32.73 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3065  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 98 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0156  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 110 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2087  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 110 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2627  transcriptional regulator  38 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0561718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3428  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1246  transcriptional regulator-like protein  27.78 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1413  virulence gene repressor RsaL  29.03 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2230  transcriptional regulator, XRE family  28.24 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.23704 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1811  XRE family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0164  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.862423  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  47.27 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2978  transcriptional regulator-like protein  30 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0304  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0956  hypothetical protein  34.43 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0315306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>