139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0946 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000318206  hitchhiker  0.000000295064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0468  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3172  XRE family transcriptional regulator  75.53 
 
 		 94 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1042  XRE family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 102 aa  124  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2738  XRE family transcriptional regulator  61.7 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0975  transcriptional regulator, XRE family  52.69 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2230  transcriptional regulator, XRE family  57.61 
 
 		 96 aa  113  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.23704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3065  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2202  helix-turn-helix domain-containing protein  55.79 
 
 		 98 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.119587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0304  XRE family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3537  transcriptional regulator, XRE family  52.81 
 
 		 97 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5216  transcriptional regulator, XRE family  48.89 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5139  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576626  normal  0.0207575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2028  transcriptional regulator, XRE family  44.21 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0653  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0786  putative DNA-binding protein  43.16 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1953  helix-turn-helix domain-containing protein  43.01 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1904  putative DNA-binding protein  41.05 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1282  putative DNA-binding protein  41.05 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1115  DNA-binding protein, putative  38.82 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0485  XRE family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4125  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0269  XRE family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.506568  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1400  hypothetical protein  53.45 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.193921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3446  XRE family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1852  XRE family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00565598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31960  transcriptional regulator protein  37.23 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2833  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3898  helix-turn-helix domain-containing protein  33.71 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1676  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1851  transcriptional regulator, XRE family  41.05 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367086  normal  0.712374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4938  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0484665  hitchhiker  0.0000000184601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3572  transcriptional regulator, XRE family  49.15 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4268  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1572  helix-turn-helix domain-containing protein  40.66 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328104  normal  0.0948744 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4313  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4359  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1765  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4424  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1487  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4246  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1198  Cro/CI family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4790  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1541  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0274839  hitchhiker  0.00170157 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4415  helix-turn-helix DNA-binding domain-containing protein  34.83 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1912  helix-turn-helix domain-containing protein  36.59 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0786  helix-turn-helix domain-containing protein  38.2 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1667  helix-turn-helix domain protein  39.58 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.130634  normal  0.758617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1708  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3074  helix-turn-helix type 3  45.76 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.620865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1709  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105629  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0283  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0317  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0550269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  54 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.425253  normal  0.20556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2941  putative DNA-binding protein  35.16 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.73394  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2433  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40389  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2477  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229914  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5658  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3850  virulence gene repressor RsaL  43.64 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04240  Transcriptional regulator with Fis-type helix-turn-helix motif  34.83 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0605  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0068  hypothetical protein  35.16 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1020  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2380  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740526  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0182  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1993  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48830  hypothetical protein  38.2 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3581  hypothetical protein  39.34 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0426544  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4437  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672925  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3671  helix-turn-helix domain-containing protein  35.87 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.179939  normal  0.801246 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31050  DNA-binding protein  34.09 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3644  DNA-binding protein  45 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1506  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735616  normal  0.160374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4706  helix-turn-helix domain-containing protein  41.51 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0139  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554857  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2627  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0561718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0928  hypothetical protein  42.25 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.729389  normal  0.315243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0720  hypothetical protein  46 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.719881  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6166  hypothetical protein  45.65 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0763  Cro/CI family transcriptional regulator-related protein  38.46 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3209  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3602  helix-turn-helix domain-containing protein  41.07 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0986  helix-turn-helix DNA-binding domain protein  39.58 
 
 		 109 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.45543 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0893  helix-turn-helix DNA-binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 109 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.641947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2809  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 109 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0860  DNA-binding protein  39.58 
 
 		 109 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0794  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1413  virulence gene repressor RsaL  26.88 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0921  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.451921  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1246  transcriptional regulator-like protein  42.37 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00074  DNA-binding protein  36 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4109  DNA-binding protein  37.25 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0125  hypothetical protein  35.48 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2677  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110858  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1845  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4312  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0881286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3986  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3684  hypothetical protein  38.98 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564903 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4058  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326996  normal  0.47831 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>