36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5547 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5547  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 133 aa  279  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.273905 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0363  XRE family transcriptional regulator  81.2 
 
 		 133 aa  243  9e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4634  helix-turn-helix domain-containing protein  90.15 
 
 		 133 aa  238  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3528  XRE family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 133 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4193  XRE family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 133 aa  190  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1536  XRE family transcriptional regulator  69.92 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3776  XRE family transcriptional regulator  65.41 
 
 		 133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4204  Cro/CI family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1649  helix-turn-helix domain-containing protein  63.16 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3859  hypothetical protein  52.67 
 
 		 132 aa  156  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.632136  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0889  putative transcriptional regulator  52.67 
 
 		 132 aa  156  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0679  transcriptional regulator, XRE family  45.8 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02843  hypothetical protein  45.8 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0676  XRE family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3199  Cro/CI family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02893  predicted DNA-binding transcriptional regulator  45.8 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2210  XRE family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.752058  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2211  hypothetical protein  42.11 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.371896  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0845  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1988  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1375  XRE family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1337  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  35.66 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4148  XRE family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0797664 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  31.78 
 
 		 168 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1834  transcriptional regulator, XRE family  60.87 
 
 		 52 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1441  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4657  XRE family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2307  hypothetical protein  29.51 
 
 		 204 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2216  hypothetical protein  22.73 
 
 		 295 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0015344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3602  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  28.92 
 
 		 334 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3850  virulence gene repressor RsaL  31.15 
 
 		 95 aa  40.8  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1708  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1413  virulence gene repressor RsaL  21.88 
 
 		 104 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>