43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4148 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4148  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  313  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0797664 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  54.17 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209704  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0845  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  38.64 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3023  XRE family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2958  XRE family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 88 aa  97.1  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0363  XRE family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1988  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1375  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 136 aa  90.9  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1337  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3859  hypothetical protein  36.88 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.632136  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0889  putative transcriptional regulator  36.88 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02843  hypothetical protein  34.09 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3199  Cro/CI family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0679  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0676  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2210  XRE family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.752058  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02893  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.09 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3528  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1536  XRE family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4634  helix-turn-helix domain-containing protein  34.07 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4193  XRE family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2211  hypothetical protein  33.1 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.371896  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5547  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.273905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3776  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4657  XRE family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4204  Cro/CI family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1649  helix-turn-helix domain-containing protein  32.35 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1441  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  35 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2307  hypothetical protein  43.94 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3671  helix-turn-helix domain-containing protein  39.56 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.179939  normal  0.801246 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  33.66 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1834  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 52 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1065  XRE family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0419  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000615648 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4076  helix-turn-helix domain-containing protein  30.85 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5658  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2641  hypothetical protein  48.65 
 
 		 52 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0808  hypothetical protein  48.65 
 
 		 52 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0637049  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2543  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0592097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04240  Transcriptional regulator with Fis-type helix-turn-helix motif  37.5 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>