36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0363 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0363  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 133 aa  277  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5547  XRE family transcriptional regulator  82.44 
 
 		 133 aa  226  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.273905 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4634  helix-turn-helix domain-containing protein  80.45 
 
 		 133 aa  223  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3528  XRE family transcriptional regulator  63.91 
 
 		 133 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4193  XRE family transcriptional regulator  67.67 
 
 		 133 aa  177  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1536  XRE family transcriptional regulator  65.41 
 
 		 133 aa  174  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4204  Cro/CI family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3776  XRE family transcriptional regulator  62.41 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1649  helix-turn-helix domain-containing protein  60.9 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3859  hypothetical protein  49.62 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.632136  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0889  putative transcriptional regulator  49.62 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0679  transcriptional regulator, XRE family  42.75 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02843  hypothetical protein  42.75 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0676  XRE family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3199  Cro/CI family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02893  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.75 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2210  XRE family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.752058  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2211  hypothetical protein  41.48 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.371896  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0845  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 131 aa  106  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1375  XRE family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1337  transcriptional regulator, XRE family  42.75 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  37.21 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4148  XRE family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0797664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1988  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1834  transcriptional regulator, XRE family  61.7 
 
 		 52 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  29.01 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4657  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1441  hypothetical protein  29.23 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2307  hypothetical protein  29.41 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  27.91 
 
 		 333 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2216  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0015344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1413  virulence gene repressor RsaL  25 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  27.05 
 
 		 334 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4076  helix-turn-helix domain-containing protein  30.7 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3850  virulence gene repressor RsaL  31.15 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>