36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1300 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  290  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4148  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0797664 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0679  transcriptional regulator, XRE family  40.77 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02843  hypothetical protein  40.77 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0676  XRE family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3199  Cro/CI family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02893  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.77 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3859  hypothetical protein  42.31 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.632136  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0889  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3528  XRE family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0363  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0845  XRE family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2210  XRE family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.752058  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  37.01 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1988  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2211  hypothetical protein  38.06 
 
 		 165 aa  83.6  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.371896  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4634  helix-turn-helix domain-containing protein  39.53 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1375  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1536  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1337  transcriptional regulator, XRE family  35.61 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4193  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1649  helix-turn-helix domain-containing protein  37.98 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4204  Cro/CI family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3776  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1441  hypothetical protein  35.56 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5547  XRE family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.273905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  36.57 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4657  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2307  hypothetical protein  34.09 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133913 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1834  transcriptional regulator, XRE family  54.35 
 
 		 52 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1065  XRE family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5658  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0139  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0317  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0550269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04240  Transcriptional regulator with Fis-type helix-turn-helix motif  33.82 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>