40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1155 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  100 
 
 		 303 aa  619  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  31.89 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  27.42 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  24.83 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  24.58 
 
 		 334 aa  95.5  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  25.61 
 
 		 335 aa  85.9  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1909  prophage ps3 protein 01  38.71 
 
 		 165 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.7495  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0850  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre domain protein  33.33 
 
 		 149 aa  75.5  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1204  hypothetical protein  31.06 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000807308 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  25.09 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1211  CPW-WPC domain protein  28.79 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0785  phage-associated protein  29.58 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.0707601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1567  uncharacterized phage-associated protein  35.54 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0921  phage-associated protein  34.65 
 
 		 156 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415452  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0416  putative prophage protein (ps3)  31.4 
 
 		 153 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.727229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0917  phage-associated protein  32.08 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2529  hypothetical protein  29.63 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.396332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  28.44 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3910  prophage ps3 protein 01  31.19 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.453546  normal  0.140581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  30.08 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0895  phage-associated protein-like protein  29.92 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2715  phage-associated protein-like  26.76 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0035  hypothetical protein  30.23 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.49607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  22.06 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0101  putative prophage protein (ps3)  30.43 
 
 		 161 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  24.44 
 
 		 335 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1323  hypothetical protein  37.5 
 
 		 161 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338891  hitchhiker  0.00835036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  27.53 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2426  hypothetical protein  24.81 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0493  hypothetical protein  31.82 
 
 		 131 aa  50.1  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.754304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3930  hypothetical protein  26.36 
 
 		 174 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4876  phage-associated protein  24.5 
 
 		 149 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136498  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1287  Putative phage-associated protein  29.66 
 
 		 169 aa  48.1  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  32.56 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  21.35 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0451  hypothetical protein  24.64 
 
 		 183 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  40.38 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4064  Uncharacterized phage-associated protein  26.02 
 
 		 164 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3399  hypothetical protein  25.86 
 
 		 191 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0015092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0920  hypothetical protein  36.21 
 
 		 83 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>