16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0920 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0920  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0895  phage-associated protein-like protein  84.15 
 
 
173 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0815  hypothetical protein  88.31 
 
 
77 aa  140  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1233  hypothetical protein  80.7 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3930  hypothetical protein  48.15 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4876  phage-associated protein  46.15 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4719  uncharacterized phage-associated protein-like protein  44.44 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281895  normal  0.115987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2715  phage-associated protein-like  54.17 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0917  phage-associated protein  35.71 
 
 
209 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1323  hypothetical protein  36.84 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338891  hitchhiker  0.00835036 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  36.84 
 
 
339 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0451  hypothetical protein  40.35 
 
 
183 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  36.21 
 
 
303 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3910  prophage ps3 protein 01  35.42 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.453546  normal  0.140581 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1909  prophage ps3 protein 01  35.14 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.7495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0785  phage-associated protein  34.04 
 
 
165 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.0707601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>