32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3930 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3930  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  357  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1323  hypothetical protein  39.63 
 
 
161 aa  114  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338891  hitchhiker  0.00835036 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2715  phage-associated protein-like  39.77 
 
 
159 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0895  phage-associated protein-like protein  31.25 
 
 
173 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4719  uncharacterized phage-associated protein-like protein  34.97 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281895  normal  0.115987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4876  phage-associated protein  32.94 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136498  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0451  hypothetical protein  29.01 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1421  hypothetical protein  27.49 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2529  hypothetical protein  34.35 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.396332 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0920  hypothetical protein  48.15 
 
 
83 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3910  prophage ps3 protein 01  26.99 
 
 
163 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.453546  normal  0.140581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0917  phage-associated protein  32.47 
 
 
209 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2017  phage-associated protein-like protein  27.71 
 
 
161 aa  61.6  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0122903  hitchhiker  0.00440161 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  28.05 
 
 
339 aa  61.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0416  putative prophage protein (ps3)  29.5 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.727229  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1567  uncharacterized phage-associated protein  23.88 
 
 
196 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  25.15 
 
 
335 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0493  hypothetical protein  28.7 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.754304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0921  phage-associated protein  25.73 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415452  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0815  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  52.4  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0101  putative prophage protein (ps3)  35.16 
 
 
161 aa  51.2  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  25 
 
 
332 aa  51.2  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0035  hypothetical protein  27.01 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.49607  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0428  phage-associated protein-like protein  23.3 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0358952 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  25.16 
 
 
334 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  26.36 
 
 
303 aa  48.9  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0785  phage-associated protein  23.49 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.0707601 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1204  hypothetical protein  46.51 
 
 
153 aa  48.5  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000807308 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1211  CPW-WPC domain protein  46.51 
 
 
153 aa  48.1  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101812 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1233  hypothetical protein  26.56 
 
 
127 aa  45.4  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1909  prophage ps3 protein 01  23.53 
 
 
165 aa  42  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.7495  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1287  Putative phage-associated protein  23.9 
 
 
169 aa  42  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>