35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2715 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2715  phage-associated protein-like  100 
 
 
159 aa  334  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4876  phage-associated protein  41.18 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4719  uncharacterized phage-associated protein-like protein  38.18 
 
 
166 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281895  normal  0.115987 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3930  hypothetical protein  39.77 
 
 
174 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0895  phage-associated protein-like protein  36.18 
 
 
173 aa  100  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0917  phage-associated protein  28.24 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  32.71 
 
 
334 aa  68.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1323  hypothetical protein  31.58 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338891  hitchhiker  0.00835036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1567  uncharacterized phage-associated protein  29.08 
 
 
196 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  30.88 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  32.82 
 
 
332 aa  62.4  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0416  putative prophage protein (ps3)  31.37 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.727229  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1204  hypothetical protein  29.06 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000807308 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  26.28 
 
 
339 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0850  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre domain protein  31.21 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0035  hypothetical protein  30 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.49607  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2017  phage-associated protein-like protein  32.23 
 
 
161 aa  57.4  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0122903  hitchhiker  0.00440161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1421  hypothetical protein  29.68 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304499 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0451  hypothetical protein  26.97 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  26.76 
 
 
303 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0920  hypothetical protein  54.17 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2529  hypothetical protein  35.54 
 
 
150 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.396332 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1233  hypothetical protein  28.18 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1211  CPW-WPC domain protein  29.51 
 
 
153 aa  54.3  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101812 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0101  putative prophage protein (ps3)  27.45 
 
 
161 aa  53.9  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1909  prophage ps3 protein 01  27.22 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.7495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0785  phage-associated protein  28.87 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.0707601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3910  prophage ps3 protein 01  25.47 
 
 
163 aa  50.8  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.453546  normal  0.140581 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0493  hypothetical protein  28.57 
 
 
131 aa  48.9  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.754304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0428  phage-associated protein-like protein  26.52 
 
 
178 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0358952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03163  hypothetical protein  26.22 
 
 
207 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414994  hitchhiker  0.00000000322947 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0815  hypothetical protein  44.9 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0921  phage-associated protein  25.9 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1996  hypothetical protein  25.17 
 
 
186 aa  42  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4064  Uncharacterized phage-associated protein  25.5 
 
 
164 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>