27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0451 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0451  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1421  hypothetical protein  53.85 
 
 		 188 aa  200  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304499 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0428  phage-associated protein-like protein  36.63 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0358952 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3930  hypothetical protein  29.01 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0917  phage-associated protein  31.16 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0895  phage-associated protein-like protein  30.25 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1323  hypothetical protein  31.62 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338891  hitchhiker  0.00835036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4876  phage-associated protein  26.88 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4719  uncharacterized phage-associated protein-like protein  31.47 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281895  normal  0.115987 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1567  uncharacterized phage-associated protein  30.07 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3910  prophage ps3 protein 01  25.93 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.453546  normal  0.140581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2715  phage-associated protein-like  26.97 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1204  hypothetical protein  27.34 
 
 		 153 aa  52.8  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000807308 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  27.27 
 
 		 339 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  26.75 
 
 		 335 aa  51.6  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2017  phage-associated protein-like protein  21.88 
 
 		 161 aa  51.2  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0122903  hitchhiker  0.00440161 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1211  CPW-WPC domain protein  26.45 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0785  phage-associated protein  30.28 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.0707601 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0035  hypothetical protein  27.21 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.49607  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0921  phage-associated protein  31.82 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415452  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  24.64 
 
 		 303 aa  45.1  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0920  hypothetical protein  40.35 
 
 		 83 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0416  putative prophage protein (ps3)  25 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.727229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3156  hypothetical protein  26.36 
 
 		 186 aa  42  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0101  putative prophage protein (ps3)  28 
 
 		 161 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0850  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre domain protein  26.61 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1287  Putative phage-associated protein  25.23 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>