28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0850 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0850  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre domain protein  100 
 
 		 149 aa  310  4.999999999999999e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1204  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000807308 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1211  CPW-WPC domain protein  47.97 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101812 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2529  hypothetical protein  40.94 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.396332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0785  phage-associated protein  34.97 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.0707601 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  33.33 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3910  prophage ps3 protein 01  32.06 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.453546  normal  0.140581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1567  uncharacterized phage-associated protein  36.29 
 
 		 196 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  34.38 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0921  phage-associated protein  32.33 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415452  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0416  putative prophage protein (ps3)  31.94 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.727229  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0101  putative prophage protein (ps3)  35.94 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4064  Uncharacterized phage-associated protein  32.17 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0493  hypothetical protein  33.08 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.754304  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0035  hypothetical protein  33.1 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.49607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  33.09 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  29.33 
 
 		 334 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1287  Putative phage-associated protein  34.59 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  30.47 
 
 		 332 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2715  phage-associated protein-like  31.21 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1909  prophage ps3 protein 01  28.35 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.7495  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4719  uncharacterized phage-associated protein-like protein  28.12 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281895  normal  0.115987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0917  phage-associated protein  26.85 
 
 		 209 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1323  hypothetical protein  26.85 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338891  hitchhiker  0.00835036 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1421  hypothetical protein  26.56 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4876  phage-associated protein  28.91 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136498  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4344  hypothetical protein  25.18 
 
 		 171 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.290178 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0451  hypothetical protein  26.61 
 
 		 183 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>