23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2731 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2731  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  344  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1261  helix-turn-helix domain-containing protein  44.12 
 
 		 146 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1151  XRE family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.736435  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1009  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3364  hypothetical protein  29.05 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0850  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 100 aa  48.1  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.07607  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1065  XRE family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1129  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 51 aa  45.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.290491  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7043  hypothetical protein  34.78 
 
 		 77 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0893  helix-turn-helix DNA-binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 109 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.641947  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0986  helix-turn-helix DNA-binding domain protein  32.14 
 
 		 109 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.45543 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0860  DNA-binding protein  32.14 
 
 		 109 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2809  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 109 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3850  virulence gene repressor RsaL  36.73 
 
 		 95 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1619  hypothetical protein  31.43 
 
 		 100 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 420 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0746  transcriptional regulator, XRE family  43.18 
 
 		 64 aa  41.6  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3898  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  47.37 
 
 		 135 aa  40.8  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 135 aa  40.8  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2216  hypothetical protein  27.62 
 
 		 295 aa  40.8  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0015344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>