More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5451 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5451  methyltransferase type 11  100 
 
 
210 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  56.08 
 
 
195 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  55.03 
 
 
196 aa  210  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  53.27 
 
 
211 aa  206  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  47.12 
 
 
198 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  47.87 
 
 
197 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  47.34 
 
 
197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  43.5 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  43.5 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  42.46 
 
 
243 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  43.43 
 
 
197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
209 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  41.26 
 
 
214 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1461  Methyltransferase type 11  44.57 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  41.44 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  36.41 
 
 
205 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12690  hypothetical protein  35.86 
 
 
250 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.09325e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  34.05 
 
 
212 aa  112  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  38.82 
 
 
241 aa  112  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13730  hypothetical protein  36.17 
 
 
233 aa  108  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.735974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5471  methyltransferase type 11  38.29 
 
 
227 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal  0.745032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1324  methyltransferase type 11  38.29 
 
 
224 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4877  methyltransferase type 12  36.84 
 
 
227 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5245  methyltransferase type 12  36.84 
 
 
227 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.654942  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4966  methyltransferase type 12  36.84 
 
 
227 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  35.32 
 
 
200 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  30.24 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  35.84 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3396  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3294  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.216078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  29.22 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  30.73 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  27.15 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  27.15 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  27.15 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  26.49 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  26.49 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  26.49 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  26.49 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  25.83 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  29.06 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  26.98 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3997  Methyltransferase type 11  28.39 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 
199 aa  62  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
251 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 
253 aa  57.4  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  25.74 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.13 
 
 
230 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2162  hypothetical protein  32.07 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0386731 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  40.96 
 
 
246 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  33.96 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  33.66 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  38.75 
 
 
255 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  30.48 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
271 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  28.47 
 
 
244 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1622  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  38.69 
 
 
407 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.254122 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  40.85 
 
 
663 aa  52  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  23.31 
 
 
246 aa  51.6  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
286 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  37.27 
 
 
277 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  31.52 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  34.62 
 
 
254 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0145  thiopurine S-methyltransferase  32.5 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285436  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  25.74 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1515  methyltransferase domain-containing protein  26.47 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  32.21 
 
 
342 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 
273 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  37.8 
 
 
780 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
257 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0173  hypothetical protein  26.16 
 
 
407 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  36.78 
 
 
286 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  37.97 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  27.97 
 
 
392 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  30.82 
 
 
304 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  35.44 
 
 
235 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 
255 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
249 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
581 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  37 
 
 
246 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  41.56 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  26.5 
 
 
390 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.18 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.88 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  27.66 
 
 
292 aa  49.3  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
252 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  31.71 
 
 
210 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>