31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0171 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0171  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  474  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2137  hypothetical protein  40.54 
 
 
246 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0601271  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.17 
 
 
711 aa  178  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2375  hypothetical protein  39.81 
 
 
247 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1042  hypothetical protein  37.12 
 
 
239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3144  hypothetical protein  35.75 
 
 
252 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0778094  normal  0.041607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1208  hypothetical protein  33.17 
 
 
236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0403711 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2599  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3246  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00816  hypothetical protein  28.92 
 
 
457 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5473  Methyltransferase type 12  28.07 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  29.65 
 
 
391 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  26.92 
 
 
746 aa  50.1  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  27.66 
 
 
238 aa  49.3  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  24.14 
 
 
332 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  25.78 
 
 
396 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  29.5 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  25.19 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
332 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
531 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1314  hypothetical protein  30.77 
 
 
298 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  24.46 
 
 
527 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3192  methyltransferase type 12  27.2 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  32.26 
 
 
318 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1888  hypothetical protein  25.97 
 
 
346 aa  43.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
457 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  24.46 
 
 
527 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  22.96 
 
 
326 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  22.96 
 
 
326 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  23.7 
 
 
346 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  23.61 
 
 
396 aa  41.6  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>