17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2137 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2137  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  507  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0601271  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2375  hypothetical protein  51.84 
 
 
247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3144  hypothetical protein  49.52 
 
 
252 aa  224  7e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0778094  normal  0.041607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.32 
 
 
711 aa  198  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0171  hypothetical protein  40.54 
 
 
235 aa  189  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1042  hypothetical protein  38.58 
 
 
239 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1208  hypothetical protein  32.78 
 
 
236 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0403711 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2599  hypothetical protein  29.35 
 
 
234 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3246  hypothetical protein  28.86 
 
 
234 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00816  hypothetical protein  23.7 
 
 
457 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5473  Methyltransferase type 12  22.62 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  34.83 
 
 
332 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  26.79 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3192  methyltransferase type 12  29.63 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  23.77 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  27.78 
 
 
297 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1314  hypothetical protein  28.74 
 
 
298 aa  42  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>