23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2599 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2599  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3246  hypothetical protein  98.29 
 
 
234 aa  461  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1208  hypothetical protein  61.21 
 
 
236 aa  250  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0403711 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1042  hypothetical protein  38.19 
 
 
239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.35 
 
 
711 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0171  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  119  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2375  hypothetical protein  29.8 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2137  hypothetical protein  29.35 
 
 
246 aa  109  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0601271  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3144  hypothetical protein  30.29 
 
 
252 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0778094  normal  0.041607 
 
 
-
 
NC_003296  RS00816  hypothetical protein  30.95 
 
 
457 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
303 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  31.07 
 
 
353 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  30.86 
 
 
407 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
286 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
457 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  25.21 
 
 
332 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
330 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  25.86 
 
 
402 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 
1162 aa  42  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
248 aa  42  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>