24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3246 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3246  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2599  hypothetical protein  98.29 
 
 		 234 aa  461  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1208  hypothetical protein  61.21 
 
 		 236 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403711 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1042  hypothetical protein  38.5 
 
 		 239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.35 
 
 		 711 aa  124  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2375  hypothetical protein  32.18 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3144  hypothetical protein  32.2 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0778094  normal  0.041607 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2137  hypothetical protein  28.86 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0601271  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_003296  RS00816  hypothetical protein  30.36 
 
 		 457 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  30.1 
 
 		 353 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  29.71 
 
 		 407 aa  49.3  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  34.45 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 		 457 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  26.39 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  33.6 
 
 		 304 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  30 
 
 		 330 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  29.2 
 
 		 310 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 		 1162 aa  41.6  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>