17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2375 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2375  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2137  hypothetical protein  51.84 
 
 
246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0601271  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3144  hypothetical protein  45.38 
 
 
252 aa  228  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0778094  normal  0.041607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.39 
 
 
711 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0171  hypothetical protein  39.81 
 
 
235 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1042  hypothetical protein  34.69 
 
 
239 aa  161  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1208  hypothetical protein  36.21 
 
 
236 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0403711 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3246  hypothetical protein  32.18 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2599  hypothetical protein  29.8 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00816  hypothetical protein  26.67 
 
 
457 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  22.37 
 
 
332 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5473  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
250 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  26.39 
 
 
746 aa  46.6  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  22.39 
 
 
581 aa  47  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  26.27 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  21.94 
 
 
312 aa  42.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>