51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3192 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3192  methyltransferase type 12  100 
 
 		 243 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  35.53 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3118  methyltransferase type 12  32.84 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0061861  hitchhiker  0.0013011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3018  hypothetical protein  36 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0192  hypothetical protein  29.29 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5240  hypothetical protein  33.83 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313704  normal  0.432968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3753  methyltransferase type 12  29.57 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  29.27 
 
 		 246 aa  105  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1615  hypothetical protein  29.86 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 457 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  32.3 
 
 		 543 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  25.55 
 
 		 406 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 317 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 323 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  26.4 
 
 		 382 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  50 
 
 		 323 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  30.85 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5473  Methyltransferase type 12  26.39 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 298 aa  46.6  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.19 
 
 		 332 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  27.1 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  26.82 
 
 		 396 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  26.95 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0957  methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 184 aa  45.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 996 aa  45.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  47.92 
 
 		 335 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2137  hypothetical protein  29.63 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0601271  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 1314 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  44.19 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  30.38 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  48.78 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0171  hypothetical protein  27.2 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 330 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  27.71 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 394 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.69 
 
 		 343 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  27.13 
 
 		 391 aa  42.4  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1314  hypothetical protein  29.47 
 
 		 298 aa  42.7  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  25.42 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 417 aa  42.4  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 		 353 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  39.34 
 
 		 353 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  27.46 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  28.7 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0423  methyltransferase domain-containing protein  50 
 
 		 297 aa  42  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2807  methyltransferase type 11  23.71 
 
 		 341 aa  42  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>