299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0280 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3118  methyltransferase type 12  48.65 
 
 
246 aa  238  9e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0061861  hitchhiker  0.0013011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3192  methyltransferase type 12  35.53 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3018  hypothetical protein  31.53 
 
 
252 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3753  methyltransferase type 12  30 
 
 
242 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  25.96 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0192  hypothetical protein  25.4 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5240  hypothetical protein  27.75 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313704  normal  0.432968 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1615  hypothetical protein  24.85 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  29.1 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.43 
 
 
345 aa  58.5  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  29.76 
 
 
231 aa  58.5  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1253  hypothetical protein  31.65 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470333  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  28.57 
 
 
260 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 
317 aa  55.1  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1314  hypothetical protein  32.73 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  43.48 
 
 
194 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  26.07 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.02 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1948  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.13 
 
 
262 aa  52.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  0.0132888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
1509 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2399  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
996 aa  52.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.969384  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.31 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.01 
 
 
239 aa  52.8  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  27.22 
 
 
332 aa  52.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  24.56 
 
 
249 aa  52.4  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.44 
 
 
244 aa  52.4  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  27.33 
 
 
233 aa  52  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
334 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
1256 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  26.8 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  25.26 
 
 
353 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
710 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.11 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  28.7 
 
 
342 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  27.92 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  27.81 
 
 
303 aa  49.7  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
337 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.25 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0171  hypothetical protein  27.66 
 
 
235 aa  49.3  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  27.95 
 
 
543 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
222 aa  48.9  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0423  methyltransferase domain-containing protein  26.15 
 
 
297 aa  48.9  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.53 
 
 
236 aa  49.3  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  28.66 
 
 
310 aa  48.9  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  27.81 
 
 
303 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  24.07 
 
 
681 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11542  hypothetical protein  28.46 
 
 
293 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
1314 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.98 
 
 
257 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  24.43 
 
 
266 aa  48.5  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
1523 aa  48.5  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2305  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.4 
 
 
256 aa  48.5  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.26 
 
 
236 aa  48.5  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
1523 aa  48.5  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.16 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  24.68 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.43 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  21.25 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  35.53 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  23.47 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  25.74 
 
 
311 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.47 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
333 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  32.23 
 
 
330 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.72 
 
 
391 aa  47.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
305 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  23.73 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  24.86 
 
 
358 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.27 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.06 
 
 
259 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
274 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.01 
 
 
253 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.4 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.37 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 
996 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
624 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  26.84 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.61 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  24.18 
 
 
237 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 
257 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2288  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.53 
 
 
236 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.37 
 
 
243 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.69 
 
 
238 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2057  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.53 
 
 
236 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00373445  unclonable  0.00000000000181282 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
353 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  26.13 
 
 
219 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  27.59 
 
 
353 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2405  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.53 
 
 
236 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031453  unclonable  0.0000107222 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.39 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2061  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.53 
 
 
236 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000216259  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2413  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.66 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  27.18 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
457 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.34 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>