34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1888 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1888  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  713    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  31.82 
 
 		 229 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0467  methyltransferase type 11  26.02 
 
 		 309 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  unclonable  0.0000104282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  24.17 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  29.41 
 
 		 229 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  30.15 
 
 		 229 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1837  methyltransferase type 12  29.08 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.322151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4005  hypothetical protein  27.94 
 
 		 250 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.151604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  37.39 
 
 		 1162 aa  49.7  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 229 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  32 
 
 		 241 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  28.68 
 
 		 229 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  28.68 
 
 		 229 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 239 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 259 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  27.94 
 
 		 229 aa  46.2  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  27.94 
 
 		 229 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  27.94 
 
 		 229 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  27.94 
 
 		 229 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 		 802 aa  46.2  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2507  methyltransferase type 12  29.58 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.38 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 228 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 261 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 241 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  34.62 
 
 		 746 aa  43.9  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0171  hypothetical protein  25.97 
 
 		 235 aa  43.1  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  47.06 
 
 		 1523 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.6 
 
 		 232 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  40.98 
 
 		 273 aa  42.7  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>