56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4005 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4005  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.151604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1652  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  38.46 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 802 aa  55.1  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  31.98 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2507  methyltransferase type 12  34.95 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1837  methyltransferase type 12  29.21 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.322151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 264 aa  52  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0467  methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  unclonable  0.0000104282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0317  Methyltransferase type 12  33.06 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1888  hypothetical protein  26.35 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 		 1162 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  37.72 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  37.72 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  39.33 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2417  hypothetical protein  33 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.320398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0924  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 330 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  37.63 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.58 
 
 		 329 aa  46.2  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  26.98 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 1287 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  38.54 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  36.9 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 1314 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.57 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1695  methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0925048  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  29.81 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  26.62 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.06 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2131  hypothetical protein  28.37 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.967434  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.04 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  32.52 
 
 		 1046 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  24.62 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0339  hypothetical protein  27.66 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0688998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 346 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  32.32 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.74 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  24.68 
 
 		 457 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.74 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  27.56 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  27.56 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  46.55 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1690  methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 235 aa  42  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  27.56 
 
 		 248 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  42  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2765  hypothetical protein  29.13 
 
 		 308 aa  42  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>