92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6137 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6137  methyltransferase UbiE  100 
 
 		 290 aa  597  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  41.32 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  36.93 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  35.89 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  33.22 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  27.8 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  25.9 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  26.64 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  27.96 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  24.79 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  23.83 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  29.26 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  29.26 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  29.26 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  29.26 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  26.06 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  27.5 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  25.88 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  26.4 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  24.65 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  31.82 
 
 		 672 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 710 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  34.17 
 
 		 711 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  30 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  28 
 
 		 371 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  28.77 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  25 
 
 		 254 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  25.73 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  28.75 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  29 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  31.07 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  27.89 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 317 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  24.88 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  26.92 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  30.34 
 
 		 194 aa  46.2  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 237 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 211 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  30.34 
 
 		 194 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 241 aa  45.8  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 237 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  26.6 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  32.37 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  28.12 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  24.75 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  28.12 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 225 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  24.08 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 226 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  26.72 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  23.63 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  26.11 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 363 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 376 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  29.1 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  29.22 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.94 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 348 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.38 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4777  methionine biosynthesis protein MetW  28.87 
 
 		 194 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 293 aa  42.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 239 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 204 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1124 aa  42.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.87 
 
 		 258 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  29.27 
 
 		 194 aa  42.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 1094 aa  42.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>