More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4594 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  100 
 
 
271 aa  530  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  37.32 
 
 
288 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4278  methyltransferase type 11  36.23 
 
 
287 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.150732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0941  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  28.25 
 
 
365 aa  85.5  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  39.84 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  32.03 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.52 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.99 
 
 
305 aa  79  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  37.82 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  24.12 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  27.16 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  33.71 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  32.09 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  36.13 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  24.05 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  24.31 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  27.23 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  36.97 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  25.3 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  35.66 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  26.48 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  37.19 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  35.62 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  28.81 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  29.25 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 
382 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  27.5 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  36.29 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  29.92 
 
 
343 aa  67  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  28.19 
 
 
559 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  34.01 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  30.82 
 
 
311 aa  65.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  30.61 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  30.14 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.65 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3810  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.29 
 
 
366 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.22407 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.76 
 
 
282 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  42.16 
 
 
293 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  31.29 
 
 
310 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  29.25 
 
 
311 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.06 
 
 
330 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  34.13 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  30 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  35.29 
 
 
208 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  28.48 
 
 
317 aa  60.1  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.27 
 
 
215 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  24.62 
 
 
280 aa  58.9  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  35 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  40.38 
 
 
276 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  32.69 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.08 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  26.04 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.08 
 
 
213 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  26.83 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.7 
 
 
202 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1075  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  31.16 
 
 
387 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  23.88 
 
 
206 aa  56.6  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  35.25 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
276 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
199 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  24.85 
 
 
572 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  32.54 
 
 
310 aa  55.5  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  27.01 
 
 
168 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  34.65 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  33.83 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2291  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 
416 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38812  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.38 
 
 
434 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
208 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1926  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.5 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0956  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  29.93 
 
 
387 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48704  predicted protein  27.62 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
208 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0464  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.22 
 
 
421 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
319 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  23.46 
 
 
239 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.95 
 
 
205 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
275 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.48 
 
 
408 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.41 
 
 
273 aa  52.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3969  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.82 
 
 
298 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00511048  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07040  conserved hypothetical protein  25.83 
 
 
489 aa  52.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.237477  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2223  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  27.94 
 
 
385 aa  52.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.399173  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.14 
 
 
241 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1019  methyltransferase type 12  26.52 
 
 
358 aa  52.8  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>