60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48704 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48704  predicted protein  100 
 
 
315 aa  654    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
286 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  29.02 
 
 
572 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
279 aa  90.9  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  26.22 
 
 
279 aa  89.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16375  predicted protein  29.31 
 
 
279 aa  89.4  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00657234  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  29.46 
 
 
559 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  25.95 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  22.53 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  26.12 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  25.17 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  29.48 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  24.56 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10531  methyltransferase  34.04 
 
 
116 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  23.19 
 
 
287 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
271 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  26.5 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.88 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  28.92 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
282 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 
271 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  24.89 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
328 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4278  methyltransferase type 11  24.9 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.150732 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  32.43 
 
 
278 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  25.42 
 
 
276 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 
267 aa  49.3  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  23.74 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  22.78 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12280  predicted protein  23.4 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0372336  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2512  O-methyltransferase family 3  32.81 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0739211  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  27.42 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  24.03 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  24.52 
 
 
377 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  24.76 
 
 
304 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
264 aa  46.2  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  25 
 
 
283 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  28.46 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 
1012 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
225 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  25 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.32 
 
 
213 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0525  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  31.93 
 
 
220 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  27.12 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  23.05 
 
 
382 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  26.34 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  28.45 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  39.68 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  27.96 
 
 
277 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  26.61 
 
 
267 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  22.04 
 
 
311 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0457  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.06 
 
 
426 aa  43.1  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.566128  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.06 
 
 
426 aa  42.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  23.39 
 
 
276 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 
249 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  28.19 
 
 
353 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>