188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0116 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0116  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 251 aa  522  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  43.53 
 
 		 254 aa  208  8e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2171  hypothetical protein  41.96 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  38.58 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2801  Methyltransferase type 11  39.77 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000632736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  38.49 
 
 		 260 aa  184  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  37.94 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  37.94 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  37.94 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  37.94 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  37.55 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  37.05 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1783  Methyltransferase type 11  39.61 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4070  methyltransferase type 11  38.22 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  0.0929931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0459  Methyltransferase type 11  36.4 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.724733  normal  0.90808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  35.27 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  34.88 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  37.87 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0330  hypothetical protein  63.08 
 
 		 127 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1452  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.86 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.86 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  25.14 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  33 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.68 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  28.98 
 
 		 387 aa  57  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.97 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  28.33 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  23.35 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2506  methyltransferase  38.71 
 
 		 71 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.860173 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  31.43 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  24.16 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  24.14 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  31.86 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5285  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 220 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  24.69 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  21.71 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.66 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  20.35 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  20.79 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.2 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  31.31 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.83 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.55 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 362 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  25.48 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  25.48 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  25.89 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  31.37 
 
 		 377 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  23.88 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.33 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1338  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.62 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0007  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.62 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3294  6-O-methylguanine DNA methyltransferase  32 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000239587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  28.44 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  24.24 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.48 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 316 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 207 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 238 aa  46.2  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 207 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1222  methyltransferase  33.03 
 
 		 272 aa  45.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 276 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 207 aa  45.4  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  29.59 
 
 		 253 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  25.71 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.71 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  31.07 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>