More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0072 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  100 
 
 
456 aa  932    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  54.95 
 
 
465 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  54.95 
 
 
465 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.48 
 
 
453 aa  478  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  52.99 
 
 
460 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.11 
 
 
470 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  48.79 
 
 
493 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  48.74 
 
 
460 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  46.99 
 
 
462 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  43.98 
 
 
450 aa  349  7e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  43.52 
 
 
450 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  44.27 
 
 
450 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  42.35 
 
 
450 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  44.08 
 
 
450 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  43.05 
 
 
450 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  42.7 
 
 
463 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  42.98 
 
 
450 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  44.25 
 
 
471 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  43.95 
 
 
448 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.58 
 
 
425 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.7 
 
 
459 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  44.58 
 
 
454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.04 
 
 
447 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  39.61 
 
 
440 aa  269  5.9999999999999995e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.11 
 
 
426 aa  263  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  43.07 
 
 
438 aa  263  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.04 
 
 
433 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  43.37 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  39.68 
 
 
438 aa  249  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  37.61 
 
 
443 aa  239  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  41.79 
 
 
438 aa  238  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.04 
 
 
422 aa  220  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  36.27 
 
 
410 aa  220  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  36.26 
 
 
419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.74 
 
 
535 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.83 
 
 
410 aa  200  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.21 
 
 
422 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  34.44 
 
 
437 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  32.5 
 
 
429 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  32.25 
 
 
429 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  40.48 
 
 
424 aa  190  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  32.25 
 
 
429 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  32.25 
 
 
429 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  32.25 
 
 
429 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.09 
 
 
415 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  31.92 
 
 
427 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  31.26 
 
 
426 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.53 
 
 
427 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  30.34 
 
 
436 aa  180  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  30 
 
 
440 aa  180  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  31.75 
 
 
429 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  32.98 
 
 
439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  32.61 
 
 
434 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  31.27 
 
 
429 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  31.02 
 
 
429 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  31.02 
 
 
429 aa  172  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  31.02 
 
 
429 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  31.02 
 
 
429 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6147  rRNA methyltransferase RsmB-like  33.75 
 
 
421 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  31.27 
 
 
429 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  30.25 
 
 
435 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  31.02 
 
 
429 aa  172  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  31 
 
 
429 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.31 
 
 
444 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  30.25 
 
 
429 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  30.25 
 
 
429 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  32.35 
 
 
452 aa  169  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  31.58 
 
 
431 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  30.26 
 
 
425 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  31.44 
 
 
452 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  30.42 
 
 
428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  29.76 
 
 
429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  30.73 
 
 
427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  30.77 
 
 
429 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  30.17 
 
 
429 aa  167  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  32.09 
 
 
436 aa  166  8e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  30.39 
 
 
428 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  28.87 
 
 
444 aa  166  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  31.63 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3583  sun protein  31.8 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  30.17 
 
 
428 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  31.92 
 
 
431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  29.74 
 
 
429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.22 
 
 
449 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  29.79 
 
 
445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  29.68 
 
 
446 aa  163  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  29.96 
 
 
428 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  31.98 
 
 
451 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  31.98 
 
 
451 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  27.86 
 
 
440 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  32.36 
 
 
437 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  30.43 
 
 
443 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  31.94 
 
 
427 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.34 
 
 
418 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  30.64 
 
 
429 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  30.39 
 
 
429 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  29.96 
 
 
428 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  30.64 
 
 
429 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  28.47 
 
 
446 aa  160  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  30.39 
 
 
428 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>