66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0764 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0764  methyltransferase type 11  100 
 
 
199 aa  414  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.855881  decreased coverage  0.00371896 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0064  Methyltransferase type 11  50 
 
 
223 aa  201  7e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0409  methyltransferase type 11  33 
 
 
210 aa  99.8  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1860  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.762875 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0871  methyltransferase type 11  32.99 
 
 
204 aa  92  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1393  methyltransferase type 11  32.34 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1314  methyltransferase type 11  30.21 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.490863 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
229 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  29.47 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1237  hypothetical protein  35.58 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1780  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115692  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  25.13 
 
 
218 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3275  Methyltransferase type 11  24.52 
 
 
217 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00288656  normal  0.645972 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2403  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
262 aa  52  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  29 
 
 
207 aa  52  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  34.04 
 
 
272 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  31.03 
 
 
265 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  27.98 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0182  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 
263 aa  49.3  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0334724  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  36.17 
 
 
272 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.65 
 
 
503 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  26.73 
 
 
279 aa  48.9  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  34.88 
 
 
272 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  36.17 
 
 
276 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  25.62 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  28.9 
 
 
262 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  25.51 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  26.26 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  32.29 
 
 
269 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.41 
 
 
230 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 
274 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 
268 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  27.59 
 
 
246 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  27.33 
 
 
235 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  27.33 
 
 
235 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  27.33 
 
 
235 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1551  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 
212 aa  44.7  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.669083  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 
235 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  32.74 
 
 
268 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  24.41 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  32.22 
 
 
275 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  32.18 
 
 
274 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  34.09 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  37.08 
 
 
275 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  34.12 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.26 
 
 
231 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  29.59 
 
 
267 aa  42  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0086  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
186 aa  42  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0770264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.49 
 
 
243 aa  41.6  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  31.52 
 
 
268 aa  41.6  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
240 aa  41.6  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
266 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0972  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 
269 aa  41.2  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.191025  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  24.44 
 
 
242 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  22.9 
 
 
234 aa  41.2  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>