67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4081 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4081  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 211 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359937  normal  0.129541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0944  Methyltransferase type 11  72.68 
 
 		 208 aa  325  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891342 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2368  methyltransferase  58.45 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2645  hypothetical protein  57.77 
 
 		 209 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2333  methyltransferase  57.49 
 
 		 209 aa  248  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0767046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2564  hypothetical protein  57.28 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2413  hypothetical protein  56.8 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00295431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2950  methyltransferase type 11  57.28 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.429444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2590  hypothetical protein  56.8 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2608  hypothetical protein  56.8 
 
 		 209 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2608  hypothetical protein  56.31 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000306401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2762  hypothetical protein  53.4 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3102  methyltransferase type 11  48.56 
 
 		 292 aa  215  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6235  Methyltransferase type 11  48.51 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5285  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  24 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  23.89 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0424  methyltransferase type 11  24.12 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0267  Methyltransferase type 11  24.74 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.992817  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  23.93 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0190  methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.561898 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0114  Methyltransferase type 11  23.98 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 1032 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  21.77 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  24.52 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 259 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  24.09 
 
 		 277 aa  48.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.67 
 
 		 259 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2515  putative SAM-dependent methyltransferase, SmtA  21.47 
 
 		 277 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  24.52 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  25.81 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  23.49 
 
 		 282 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  24.44 
 
 		 277 aa  45.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  30.77 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  25.45 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  24.82 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.42 
 
 		 275 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  25.26 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3294  6-O-methylguanine DNA methyltransferase  24.35 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000239587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  25.29 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  26.67 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  24.82 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  30.53 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  24.22 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.36 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  23.37 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  28.35 
 
 		 247 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  20.15 
 
 		 885 aa  42.4  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  25.96 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2087  Methyltransferase type 11  22.42 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.261869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  25.61 
 
 		 208 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  38.46 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  23.48 
 
 		 201 aa  42  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 247 aa  41.6  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  25.96 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>