262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1601 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1601  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0256  methyltransferase type 11  100 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0284  methyltransferase type 11  93.78 
 
 		 209 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07904  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 		 325 aa  102  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.414403  normal  0.323526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1368  methyltransferase type 12  33.77 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  32.39 
 
 		 221 aa  89  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1392  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  35.21 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2277  methyltransferase type 11  33.75 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2795  hypothetical protein  38.04 
 
 		 135 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.941377  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 243 aa  62  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  32.45 
 
 		 456 aa  61.6  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.05 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  29.1 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0741  methyltransferase type 11  36.49 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0142971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  35 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 436 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32.39 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  25.12 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.44 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  40 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  34.15 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.67 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  36.11 
 
 		 265 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.78 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.62 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 269 aa  51.6  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.65 
 
 		 236 aa  51.6  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  34.39 
 
 		 330 aa  52  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.89 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  34.75 
 
 		 439 aa  51.6  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  26.37 
 
 		 235 aa  51.6  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 276 aa  51.6  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.1 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  31.33 
 
 		 338 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.57 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  33.54 
 
 		 329 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  31.47 
 
 		 436 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.12 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  40.95 
 
 		 312 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.11 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  28.08 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.93 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  36.64 
 
 		 269 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.16 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  33.54 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1847  methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  34.03 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  36.21 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  36.64 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 253 aa  49.3  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  32.68 
 
 		 255 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 331 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38925  predicted protein  39.71 
 
 		 281 aa  49.3  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 269 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 311 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 706 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.56 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  27.18 
 
 		 253 aa  48.9  0.00006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.97 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 261 aa  48.5  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 457 aa  48.5  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  31.76 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  36.05 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.13 
 
 		 250 aa  48.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  23.45 
 
 		 249 aa  48.1  0.00009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  40.48 
 
 		 436 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  34.26 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  32.69 
 
 		 331 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2269  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.06 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0018  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.21 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000241496  hitchhiker  0.00000138707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 261 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.77 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.78 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>