212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0284 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0284  methyltransferase type 11  100 
 
 
209 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1601  hypothetical protein  93.78 
 
 
209 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0256  methyltransferase type 11  93.78 
 
 
209 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07904  conserved hypothetical protein  32.46 
 
 
325 aa  104  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.414403  normal  0.323526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1368  methyltransferase type 12  33.12 
 
 
210 aa  102  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  32.64 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2277  methyltransferase type 11  33.51 
 
 
215 aa  88.2  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1392  methyltransferase type 11  30.92 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  35.21 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2795  hypothetical protein  35.23 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.941377  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  31.97 
 
 
456 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  30.72 
 
 
436 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  34.27 
 
 
436 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  34.16 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
259 aa  58.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.4 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  36.25 
 
 
439 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.55 
 
 
155 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
252 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0741  methyltransferase type 11  35.81 
 
 
173 aa  56.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0142971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.52 
 
 
258 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 
244 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  32.26 
 
 
263 aa  55.5  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  33.95 
 
 
329 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.1 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
248 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.52 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  41 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  33.57 
 
 
260 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
248 aa  52.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  28.1 
 
 
303 aa  52.4  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  34.15 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  28.77 
 
 
201 aa  52  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.81 
 
 
230 aa  52.4  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32.61 
 
 
202 aa  52  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  37.62 
 
 
253 aa  51.6  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  37.04 
 
 
265 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
269 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.14 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.78 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
269 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  25.24 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
457 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1847  methyltransferase type 11  28.03 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.57 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.97 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  32.32 
 
 
331 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  39.05 
 
 
312 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  27.03 
 
 
284 aa  48.9  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 
225 aa  48.9  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
207 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
262 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  33.73 
 
 
330 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  40.45 
 
 
338 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.89 
 
 
231 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  40.23 
 
 
436 aa  48.5  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
201 aa  48.5  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  31.71 
 
 
331 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  27.21 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.91 
 
 
245 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.32 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3569  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  33.99 
 
 
233 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  35.42 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  32 
 
 
561 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 
239 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
233 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  33.1 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
269 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.13 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38925  predicted protein  38.24 
 
 
281 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14201  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  32 
 
 
561 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
241 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.28 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.28 
 
 
256 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.28 
 
 
256 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  23.29 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  30.73 
 
 
266 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
276 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  26.13 
 
 
235 aa  46.2  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.78 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 
269 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  34.48 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  30.41 
 
 
224 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.28 
 
 
256 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.28 
 
 
256 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 
201 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.69 
 
 
235 aa  45.4  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>