16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0410 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0410  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  67.69 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  66.15 
 
 		 213 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  58.06 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  45.16 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  42.62 
 
 		 201 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  38.71 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 207 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  40.32 
 
 		 204 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  35.48 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  40.98 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  40.98 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  40.32 
 
 		 201 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  40.32 
 
 		 201 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 221 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>