More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0472 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0472  methyltransferase type 11  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4465  Methyltransferase type 11  67.1 
 
 		 232 aa  298  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  63.04 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3411  type 11 methyltransferase  60.87 
 
 		 232 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0607  Methyltransferase type 11  63.88 
 
 		 232 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0317201  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  53.92 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  51.94 
 
 		 252 aa  198  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20830  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  44.1 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  41.75 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  38.21 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  33.57 
 
 		 658 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.96 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  31.71 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  34.82 
 
 		 629 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.96 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  26.16 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.28 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.91 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.48 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  27.01 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 		 1106 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2422  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  0.0203138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.33 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  34 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  41.58 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.33 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  40.52 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  34.75 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.2 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  32 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  32.7 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  35.09 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  29.38 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  34.53 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  32.78 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  34.03 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.78 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.02 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 331 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.19 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.07 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.8 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  38.61 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.74 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.09 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  36 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.72 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  37 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.18 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  38.24 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.16 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  38.53 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.26 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.62 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 178 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 310 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.95 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>