More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3411 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3411  type 11 methyltransferase  100 
 
 
232 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  67.67 
 
 
243 aa  332  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4465  Methyltransferase type 11  65.52 
 
 
232 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0472  methyltransferase type 11  60.87 
 
 
251 aa  265  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0607  Methyltransferase type 11  57.89 
 
 
232 aa  239  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0317201  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  47.49 
 
 
252 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  50.93 
 
 
245 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20830  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  44.34 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  40.74 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 
262 aa  62.4  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
255 aa  62  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
278 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
278 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
278 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
276 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.07 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
259 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.37 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2418  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
216 aa  59.3  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.18 
 
 
266 aa  58.9  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.37 
 
 
256 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
257 aa  58.9  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 
256 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.35 
 
 
256 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  27.27 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  40 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.53 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.23 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  29.73 
 
 
629 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  34.64 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  34.64 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  34.64 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  42.42 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.27 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.06 
 
 
239 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
210 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  36.27 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  37.38 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  39.8 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
348 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.35 
 
 
256 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
312 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  28.19 
 
 
243 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.64 
 
 
255 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
305 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
269 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
249 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  33.96 
 
 
263 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 
207 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.11 
 
 
250 aa  55.5  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
269 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
254 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
312 aa  55.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 
310 aa  55.1  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  28.96 
 
 
226 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  29.38 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.07 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  36.28 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 
319 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
209 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
250 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
291 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.19 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.58 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.19 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
304 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  43.75 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.19 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.19 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
274 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  30.46 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  38.6 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6235  methyltransferase type 11  36.94 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  38.05 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  28.92 
 
 
275 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  26.26 
 
 
203 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  38.1 
 
 
208 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.79 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  25.19 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
335 aa  52.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.82 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
206 aa  52.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>