More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0607 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0607  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 232 aa  460  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0317201  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0472  methyltransferase type 11  63.88 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4465  Methyltransferase type 11  64.04 
 
 		 232 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  57.33 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3411  type 11 methyltransferase  56.9 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  53.74 
 
 		 245 aa  218  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  51.18 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20830  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  46.32 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  34.05 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  39.72 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.36 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  33.13 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  41.24 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  41.24 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  41.28 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  30.63 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  41.24 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  35.45 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  41.18 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.97 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.2 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.63 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  27.65 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.72 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  32.39 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  29.91 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.96 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  31.2 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  38.53 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 1106 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 348 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  30.35 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.93 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.88 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  36 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  31.43 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2558  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 288 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  35.45 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.95 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 273 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 173 aa  52.4  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 310 aa  52.4  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.35 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.39 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.45 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  30.73 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.06 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 266 aa  52  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2782  methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.65 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.78 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  29.41 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  33.63 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  40.87 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  29.26 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  37.38 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  32.73 
 
 		 1005 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>