34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3273 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3273  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  267  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000980907  hitchhiker  0.000172386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1091  Methyltransferase type 11  56.25 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1826  Methyltransferase type 11  44.66 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00341289  normal  0.127097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2642  methyltransferase type 11  48.81 
 
 
208 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6235  methyltransferase type 11  50 
 
 
204 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6211  methyltransferase type 11  50.72 
 
 
202 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 
203 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  43.48 
 
 
204 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  43.48 
 
 
204 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  48.39 
 
 
229 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  44.12 
 
 
216 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  40 
 
 
205 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  43.08 
 
 
206 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4138  methyltransferase type 12  55.32 
 
 
210 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.950968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4063  methyltransferase type 12  55.32 
 
 
210 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1427  Methyltransferase type 11  50 
 
 
220 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00176149  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  36.23 
 
 
209 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4292  methyltransferase type 12  53.19 
 
 
210 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.401228  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4720  phospholipid methyltransferase  43.94 
 
 
203 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.665331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4481  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
213 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980043  normal  0.396448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53910  phospholipid methyltransferase  43.94 
 
 
216 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260165  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.76 
 
 
206 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
206 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0932  putative methyltransferase  39.71 
 
 
217 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1708  methyltransferase type 11  25 
 
 
187 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0694395  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2621  Methyltransferase type 11  50 
 
 
219 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3946  hypothetical protein  58.82 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2133  methyltransferase type 12  46.81 
 
 
210 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.153525  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4571  methyltransferase type 12  46.81 
 
 
209 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3814  methyltransferase type 11  42.19 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0196  methyltransferase type 11  43.86 
 
 
213 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11171  hypothetical protein  46.94 
 
 
216 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  37.7 
 
 
210 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
195 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>