293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11980 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_11980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
258 aa  518  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4208  Methyltransferase type 11  66.27 
 
 
258 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0336  Methyltransferase type 11  52.14 
 
 
259 aa  226  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0390472  normal  0.038594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0837  Methyltransferase type 11  45.31 
 
 
253 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.702425  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  50.6 
 
 
377 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  50.81 
 
 
429 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3108  Methyltransferase type 11  50 
 
 
246 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
264 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  31.95 
 
 
260 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  43.97 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  23.03 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  38.71 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  38.71 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  37.9 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  38.71 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  32.88 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  40 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0251  methyltransferase type 11  43.52 
 
 
165 aa  58.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.999818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  35 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
234 aa  56.6  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  30.12 
 
 
229 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
235 aa  56.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
235 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  36.61 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.89 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  41.58 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.95 
 
 
213 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.53 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4235  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0933321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.88 
 
 
256 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  50.91 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  39.39 
 
 
258 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.19 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  42.71 
 
 
255 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1441  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.83 
 
 
208 aa  52.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000764793  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1298  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
165 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.18 
 
 
209 aa  52  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2520  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.41 
 
 
233 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.783143  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  41.3 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  40.45 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
254 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  37.1 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  37 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  41.67 
 
 
254 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  43.4 
 
 
187 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.58 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  34.56 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  26.67 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0977  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.86 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.610826 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.02 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.67 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  26.67 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  37.84 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.82 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  37.08 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
256 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  35.23 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  37.08 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.24 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  40 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
255 aa  49.7  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  37.08 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  28.8 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.92 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2001  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323981  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1941  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
194 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.46 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  37.5 
 
 
264 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  39.18 
 
 
231 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  37.29 
 
 
275 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.76 
 
 
229 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.48 
 
 
199 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  38.95 
 
 
221 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.03 
 
 
256 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  34.19 
 
 
258 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  35.29 
 
 
243 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
256 aa  48.9  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 
263 aa  48.9  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  32.94 
 
 
209 aa  48.9  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
207 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.04 
 
 
256 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
248 aa  48.9  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.23 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
223 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1091  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 
206 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0894  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.92 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000138444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.55 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  30.69 
 
 
212 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>