More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0134 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 253 aa  494  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  57.2 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  56.13 
 
 		 255 aa  231  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  51.21 
 
 		 252 aa  222  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  32.68 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 241 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  32.55 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  32.03 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  32.16 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  31.78 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  31.4 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  31.78 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  31.78 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  31.25 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  30.86 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  34.75 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  35.98 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  33.89 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  32.1 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  31.68 
 
 		 254 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  28.63 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  41.49 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  29.3 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  28.94 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  35.36 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  34.41 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  29.79 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  28.51 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  33.84 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  32.38 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  36.28 
 
 		 242 aa  99  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  36.63 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  30.23 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  33.47 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  30.92 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  29.88 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  32.35 
 
 		 278 aa  85.1  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  28.22 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  31.93 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  34.87 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  28.35 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  29.92 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  32.65 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  45.63 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  32.46 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 342 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  39.09 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  29.07 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  35.24 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  26.06 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  26.06 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  21.36 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  29.7 
 
 		 342 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>