75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2753 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2753  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  9e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  50 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2209  transcription activator, effector binding  37.82 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  33.55 
 
 		 308 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  34.01 
 
 		 294 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 326 aa  73.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  31.88 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  29.87 
 
 		 283 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  28.03 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2133  transcription activator effector binding  27.54 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.774789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  31.17 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  31.17 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 292 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3349  transcription activator, effector binding  28.19 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 287 aa  53.9  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 288 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 279 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0124  transcription activator effector binding  28.57 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 277 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2480  transcription activator, effector binding  29.13 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 325 aa  48.5  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  21.88 
 
 		 296 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2547  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0684742  hitchhiker  0.0000000036137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2745  transcriptional regulator, AraC family  22.64 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.611146  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  27.5 
 
 		 288 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 		 286 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 296 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 296 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 296 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  27.62 
 
 		 286 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  26.88 
 
 		 288 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  26.88 
 
 		 288 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  26.88 
 
 		 288 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  20.62 
 
 		 296 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  20.62 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2741  hypothetical protein  23.57 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.19844e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2546  hypothetical protein  23.57 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000652694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2467  hypothetical protein  24.2 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2788  hypothetical protein  23.9 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2502  hypothetical protein  23.57 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2733  hypothetical protein  23.57 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000951736  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2397  DNA gyrase inhibitor  23.08 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2184  DNA gyrase inhibitor  23.08 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2577  DNA gyrase inhibitor  23.02 
 
 		 157 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2284  DNA gyrase inhibitor  23.08 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0569461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  34.57 
 
 		 300 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 296 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2238  DNA gyrase inhibitor  23.08 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.478709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2231  DNA gyrase inhibitor  23.08 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107411  normal  0.171145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6018  hypothetical protein  24.27 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0418  transcription activator, effector binding  24.27 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1052  DNA gyrase inhibitor  23.74 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170354 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1631  DNA gyrase inhibitor  23.74 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0493763 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 281 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 288 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2865  DNA gyrase inhibitor  23.74 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01912  DNA gyrase inhibitor  23.74 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01898  hypothetical protein  23.74 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 265 aa  40.8  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  26.42 
 
 		 288 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 289 aa  40.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  21.25 
 
 		 296 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2147  DNA gyrase inhibitor  23.74 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 436 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>