46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2577 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2577  DNA gyrase inhibitor  100 
 
 
157 aa  331  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0670847 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01912  DNA gyrase inhibitor  71.61 
 
 
157 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01898  hypothetical protein  71.61 
 
 
157 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2865  DNA gyrase inhibitor  71.61 
 
 
157 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1052  DNA gyrase inhibitor  70.97 
 
 
157 aa  243  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.170354 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1631  DNA gyrase inhibitor  71.61 
 
 
157 aa  243  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0493763 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1648  transcription activator effector binding protein  71.61 
 
 
157 aa  241  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1226  DNA gyrase inhibitor  71.61 
 
 
157 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0804022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2300  DNA gyrase inhibitor  71.61 
 
 
157 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2231  DNA gyrase inhibitor  69.68 
 
 
155 aa  239  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107411  normal  0.171145 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2284  DNA gyrase inhibitor  69.68 
 
 
155 aa  239  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0569461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2238  DNA gyrase inhibitor  69.68 
 
 
155 aa  239  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.478709  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2397  DNA gyrase inhibitor  69.68 
 
 
155 aa  239  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2184  DNA gyrase inhibitor  69.03 
 
 
155 aa  238  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2147  DNA gyrase inhibitor  70.32 
 
 
157 aa  238  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3021  DNA gyrase inhibitor  41.48 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1593  transcription activator effector binding  30.07 
 
 
154 aa  87  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.350855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  26.58 
 
 
326 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  24.65 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  24.6 
 
 
299 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2133  transcription activator effector binding  28.4 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.774789  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  27.64 
 
 
300 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 
314 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 
283 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  25.49 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  24.2 
 
 
326 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 
286 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0124  transcription activator effector binding  28.03 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  22.01 
 
 
436 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  25.9 
 
 
283 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 
293 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 
292 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 
289 aa  44.3  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  22.88 
 
 
288 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  24.64 
 
 
294 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0338  hypothetical protein  20.13 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  22.08 
 
 
277 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2753  hypothetical protein  23.02 
 
 
156 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 
293 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  26.55 
 
 
159 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 
293 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2209  transcription activator, effector binding  23.74 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  26.55 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
277 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  19.83 
 
 
296 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
287 aa  40.4  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>