65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1648 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1648  transcription activator effector binding protein  100 
 
 		 157 aa  328  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1226  DNA gyrase inhibitor  100 
 
 		 157 aa  328  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0804022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2300  DNA gyrase inhibitor  98.73 
 
 		 157 aa  325  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01898  hypothetical protein  97.45 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01912  DNA gyrase inhibitor  97.45 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2865  DNA gyrase inhibitor  97.45 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1052  DNA gyrase inhibitor  96.82 
 
 		 157 aa  320  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170354 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1631  DNA gyrase inhibitor  96.82 
 
 		 157 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0493763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2147  DNA gyrase inhibitor  96.18 
 
 		 157 aa  316  7.999999999999999e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2577  DNA gyrase inhibitor  71.61 
 
 		 157 aa  241  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2284  DNA gyrase inhibitor  70.97 
 
 		 155 aa  238  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0569461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2238  DNA gyrase inhibitor  70.97 
 
 		 155 aa  238  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.478709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2231  DNA gyrase inhibitor  70.97 
 
 		 155 aa  238  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107411  normal  0.171145 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2397  DNA gyrase inhibitor  70.97 
 
 		 155 aa  238  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2184  DNA gyrase inhibitor  70.32 
 
 		 155 aa  237  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3021  DNA gyrase inhibitor  35.71 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1593  transcription activator effector binding  31.82 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.350855  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  26.8 
 
 		 299 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  29.38 
 
 		 326 aa  67.4  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  28.08 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 		 436 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  28.78 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 326 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2133  transcription activator effector binding  26.35 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.774789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  28.78 
 
 		 294 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 314 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 		 286 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 		 296 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 284 aa  50.4  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 296 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 296 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 296 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  26.62 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2209  transcription activator, effector binding  27.1 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 292 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  31.2 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 293 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  25.44 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 291 aa  45.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  29.63 
 
 		 286 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 293 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 293 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0124  transcription activator effector binding  25.76 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  22.98 
 
 		 296 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  22.36 
 
 		 296 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  25 
 
 		 308 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3488  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  28.91 
 
 		 160 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 296 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  38.24 
 
 		 265 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  22.81 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  29.06 
 
 		 283 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2788  hypothetical protein  25.98 
 
 		 166 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178794  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 288 aa  41.2  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3201  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  28.91 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0674  transcription activator effector binding  28.91 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.112574 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02845  hypothetical protein  28.91 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.429305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0677  transcription activator effector binding protein  28.91 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02895  predicted transcriptional regulator  28.91 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4332  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain protein  30.91 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3312  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  28.91 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.735437  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  29.71 
 
 		 289 aa  40.8  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2764  hypothetical protein  24.41 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000234477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2547  transcriptional regulator, AraC family  25.2 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0684742  hitchhiker  0.0000000036137 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>