88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A2788 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A2788  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  346  8e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2764  hypothetical protein  90.36 
 
 
166 aa  318  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000234477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2467  hypothetical protein  93.63 
 
 
159 aa  311  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149967  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2502  hypothetical protein  90.45 
 
 
159 aa  301  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2546  hypothetical protein  90.45 
 
 
159 aa  299  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000652694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2733  hypothetical protein  90.45 
 
 
159 aa  299  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000951736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2741  hypothetical protein  89.81 
 
 
159 aa  299  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.19844e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2745  transcriptional regulator, AraC family  87.34 
 
 
158 aa  294  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.611146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2547  transcriptional regulator, AraC family  85.9 
 
 
156 aa  284  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0684742  hitchhiker  0.0000000036137 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  30 
 
 
326 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  32.72 
 
 
436 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  30.72 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  29.94 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  29.68 
 
 
283 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  28.3 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  26.28 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 
292 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2133  transcription activator effector binding  31.5 
 
 
152 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.774789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 
293 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 
293 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  25 
 
 
159 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  24.36 
 
 
314 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 
286 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 
293 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  25 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  24.03 
 
 
291 aa  55.8  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2209  transcription activator, effector binding  32.26 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6018  hypothetical protein  24.84 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0418  transcription activator, effector binding  24.84 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  28.1 
 
 
296 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 
296 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 
296 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  23.39 
 
 
287 aa  51.6  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3349  transcription activator, effector binding  31.88 
 
 
160 aa  50.8  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 
296 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3488  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  28.12 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 
279 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  24.68 
 
 
289 aa  48.9  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 
296 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  31.11 
 
 
265 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 
296 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0677  transcription activator effector binding protein  28.12 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 
279 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3457  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain protein  28.12 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02895  predicted transcriptional regulator  28.12 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02845  hypothetical protein  28.12 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.429305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0674  transcription activator effector binding  28.12 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.112574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3201  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  28.12 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3312  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  28.12 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.735437  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 
297 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0124  transcription activator effector binding  23.94 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 
287 aa  47.8  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 
296 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 
296 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 
296 aa  47.4  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4332  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain protein  27.34 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2184  DNA gyrase inhibitor  25.78 
 
 
155 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 
296 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2284  DNA gyrase inhibitor  25.78 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0569461 
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  24.5 
 
 
310 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2231  DNA gyrase inhibitor  25.78 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107411  normal  0.171145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2238  DNA gyrase inhibitor  25.78 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.478709  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2480  transcription activator, effector binding  23.53 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2397  DNA gyrase inhibitor  25.78 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  26.88 
 
 
288 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2147  DNA gyrase inhibitor  26.52 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  26.88 
 
 
288 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  26.88 
 
 
288 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  25.16 
 
 
288 aa  45.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  26.88 
 
 
288 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01898  hypothetical protein  26.77 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01912  DNA gyrase inhibitor  26.77 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2865  DNA gyrase inhibitor  26.77 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1052  DNA gyrase inhibitor  26.77 
 
 
157 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.170354 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1631  DNA gyrase inhibitor  26.77 
 
 
157 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0493763 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  31.4 
 
 
299 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2753  hypothetical protein  23.9 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  23.6 
 
 
284 aa  43.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0338  hypothetical protein  26.17 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0472  transcription activator effector binding  25.18 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.506351  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 
294 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  24.53 
 
 
286 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1648  transcription activator effector binding protein  25.98 
 
 
157 aa  41.2  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1226  DNA gyrase inhibitor  25.98 
 
 
157 aa  41.2  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0804022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2300  DNA gyrase inhibitor  25.98 
 
 
157 aa  41.2  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>