81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS2546 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007530  GBAA_2733  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  332  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000951736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2546  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  332  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000652694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2502  hypothetical protein  98.74 
 
 
159 aa  328  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2741  hypothetical protein  98.74 
 
 
159 aa  327  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.19844e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2467  hypothetical protein  95.6 
 
 
159 aa  320  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2788  hypothetical protein  90.45 
 
 
166 aa  299  9e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2764  hypothetical protein  86.62 
 
 
166 aa  291  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000234477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2745  transcriptional regulator, AraC family  85.26 
 
 
158 aa  284  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.611146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2547  transcriptional regulator, AraC family  83.33 
 
 
156 aa  278  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0684742  hitchhiker  0.0000000036137 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  30.38 
 
 
326 aa  84  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
326 aa  80.5  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 
288 aa  77  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  29.3 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 
436 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  28.1 
 
 
308 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2133  transcription activator effector binding  34.38 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.774789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2209  transcription activator, effector binding  34.68 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 
283 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  28.21 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  26.83 
 
 
287 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  25.64 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 
283 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 
291 aa  57.8  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 
292 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  24.2 
 
 
293 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  24.2 
 
 
293 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  24.36 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  25.49 
 
 
286 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
297 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
296 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 
296 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 
296 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  23.57 
 
 
293 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3349  transcription activator, effector binding  29.41 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808619  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  22.44 
 
 
314 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 
296 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  22.44 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6018  hypothetical protein  24.18 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 
296 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 
296 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 
296 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0418  transcription activator, effector binding  24.18 
 
 
154 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  25.16 
 
 
288 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 
296 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  25.98 
 
 
289 aa  47.4  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0124  transcription activator effector binding  21.79 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  23.84 
 
 
310 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 
325 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  28.89 
 
 
265 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2184  DNA gyrase inhibitor  24.22 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  25.66 
 
 
296 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  25.49 
 
 
296 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  23.6 
 
 
284 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2238  DNA gyrase inhibitor  24.22 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.478709  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2284  DNA gyrase inhibitor  24.22 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0569461 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2231  DNA gyrase inhibitor  24.22 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107411  normal  0.171145 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2397  DNA gyrase inhibitor  24.22 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 
279 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 
279 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  25.16 
 
 
288 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2753  hypothetical protein  23.57 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  24.17 
 
 
294 aa  42.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  25.16 
 
 
288 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  25.16 
 
 
288 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  25.16 
 
 
288 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2116  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
287 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  27.96 
 
 
299 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2480  transcription activator, effector binding  22.38 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4566  transcriptional regulator, AraC family  24.68 
 
 
293 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2147  DNA gyrase inhibitor  25 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  24.77 
 
 
287 aa  41.2  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01898  hypothetical protein  25.2 
 
 
157 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1631  DNA gyrase inhibitor  25.2 
 
 
157 aa  40.8  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0493763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2865  DNA gyrase inhibitor  25.2 
 
 
157 aa  40.8  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  23.68 
 
 
289 aa  40.8  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01912  DNA gyrase inhibitor  25.2 
 
 
157 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0338  hypothetical protein  26.47 
 
 
154 aa  40.8  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1052  DNA gyrase inhibitor  25.2 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.170354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  21.66 
 
 
286 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  23.68 
 
 
289 aa  40.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4366  transcription activator, effector binding  22.84 
 
 
155 aa  40.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0866896  normal  0.40672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>