More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_13590 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_13590  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  100 
 
 		 71 aa  150  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1683  AraC family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  48.33 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  48.33 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  48.33 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  48.33 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0679  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 289 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0014238  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  42.86 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0814  right origin-binding protein  42.86 
 
 		 288 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3481  right origin-binding protein  42.86 
 
 		 288 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  45.16 
 
 		 198 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3609  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 288 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3788  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  42.86 
 
 		 198 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  45.16 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04272  DNA-binding transcriptional activator  43.33 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3601  transcriptional regulator, AraC family  43.33 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4996  right origin-binding protein  43.33 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4837  right origin-binding protein  43.33 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4944  right origin-binding protein  43.33 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4943  right origin-binding protein  43.33 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4946  right origin-binding protein  43.33 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4910  right origin-binding protein  43.33 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04237  hypothetical protein  43.33 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3660  AraC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4632  right origin-binding protein  43.33 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4994  right origin-binding protein  43.33 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4998  right origin-binding protein  43.33 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5910  right origin-binding protein  43.33 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0557  AraC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3585  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  41.27 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3485  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3869  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  41.27 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  39.68 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  39.68 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  39.68 
 
 		 293 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 		 296 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4660  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  39.34 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4516  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  39.34 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4610  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  39.34 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0547666  normal  0.902957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  39.34 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4609  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  39.34 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.917171  normal  0.375209 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  39.34 
 
 		 513 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0529  transcriptional regulator, AraC family  39.68 
 
 		 288 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2484  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151206  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1997  DNA-binding transcriptional activator MarA  36.07 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 295 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2387  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000368739  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01490  DNA-binding transcriptional dual activator of multiple antibiotic resistance  34.43 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2115  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000178307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 298 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1651  DNA-binding transcriptional activator MarA  34.43 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00571718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2127  DNA-binding transcriptional activator MarA  34.43 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.299134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 287 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1674  DNA-binding transcriptional activator MarA  34.43 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01501  hypothetical protein  34.43 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0218777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1733  DNA-binding transcriptional activator MarA  34.43 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1816  DNA-binding transcriptional activator MarA  34.43 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1639  DNA-binding transcriptional activator MarA  34.43 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1691  DNA-binding transcriptional activator MarA  34.43 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2755  transcriptional regulator, AraC family  38.98 
 
 		 300 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1624  DNA-binding transcriptional activator MarA  34.43 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.936948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2145  DNA-binding transcriptional activator MarA  34.43 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1632  DNA-binding transcriptional activator MarA  34.43 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03934  DNA-binding transcriptional dual regulator  38.33 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0326041  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3930  transcriptional regulator, AraC family  38.33 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4304  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  38.33 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3965  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  38.33 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105984 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  38.33 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03894  hypothetical protein  38.33 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0334168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 278 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4615  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  38.33 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4580  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  38.33 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5565  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  38.33 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.601347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2833  AraC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360969  hitchhiker  0.00326998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  38.33 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  38.33 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  40 
 
 		 288 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  38.33 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  40 
 
 		 326 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 296 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  40.74 
 
 		 294 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2466  transcriptional regulator, AraC family  40.68 
 
 		 313 aa  50.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3772  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  40.32 
 
 		 198 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  40 
 
 		 299 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 322 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 515 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 303 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  40.74 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2238  AraC family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 297 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0266  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  36.07 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>